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1、方舟子设立新语丝网站，通过发表自己的文章以及刊登网友文章，揭发中国科学界和教育界的学术腐败现象，批判新闻界的不真实报道，以及批判基督教、伪科学、伪气功、伪环保，批评中医等。
2、是许多知名平面媒体的专栏作家，并且出版过一些以科普和反学术腐败等为题材的著作
方舟子简介：
崇拜鲁迅，是个理想主义的践行者。
中科大本科毕业后在美国十年接受硕士博士教育并从事五年的博士后研究，有着很好的教育和学术背景，在两千年左右回国，发现国内出现大量的造假，出于看不惯的义愤和本身性格的执着，开始揭露各种学术造假，并从事科学普及工作。写了二十多本科普和文化著作，开办著名的揭露学术造假的网站“新语丝”。下面主要谈一下对他的争议：
1、由于方的铁面无情和直面抨击，使得各类有着造假嫌疑的利益团体对其咬牙切齿，其中包括中医，保健品，各类学术团体，宗教团体、卖有机食品等。
2、方擅长攻击虚假谣言和错误常识，而谣言的产生和传播一定有民众心理需求的土壤，如转基因谣言来自民众对政府食品安全问题的担忧，坐月子虽无科学根据，但来自民间习俗和惯性思维。因此，无法以科学来判断“是非”的民众普遍以道德的尺度认为方是为“恶”说话，维护“恶”和攻击“善”的人。
3、普遍国人对这样性格和具有这样价值观的人也无法认同和理解，把他的动机犬儒的解释为炒作。
4、方舟子也讨厌以占队和立场判断是非，所以社会的左派和右派也都把方舟子看成异类和眼中钉。
5、方执着于打击社会上各领域爆的大名的文化偶像，包括韩寒、李开复，唐骏等，认为这些人出名途径存有造假。这也使得他受到这类粉丝的围攻和谩骂，被认为是最不受欢迎的人
6，由于其鲜明的科学主义立场使得很多在人文学科中试图调和科学与哲学关系的一些学者对其也有所抵触。
7、除此之外，从方的经历来看一直都在大学研究院，并很早混迹于网络，是中文网络的先驱，没有在中国社会“混世”的经验，因而有着极为少见的不讲面子和不理人情世故的人生态度，同时较好的学养和品格使得他骨子里有着文人的清高和骄傲，看不起世道上的常见的投机和钻营，有时在中国这也是必要的生存之道，因而，这使得很多原来与方交好并无利益冲突的人，也对其这种直接和骄傲的态度和性格十分不满和不适，进一步产生矛盾和摩擦，最为典型的是罗永浩和王志安。崔永元最先和其交恶也在于此，一直备受赞誉的崔无法忍受方在科学问题上对他直接和骄傲的回击。
这多方面原因使得方一直被各种争议包围。被认为是中国得罪人最多的人。但他似乎并不在意，严密的逻辑思维和极佳的学术素养是其依傍的根本，因此，他认为在真和假之间不存在模糊和妥协。他不在乎谤满天下。他是个特立独行的人。
内容真实，以客观角度把把新闻的真实内容给大家
一、责 任
第一条 广播电视编辑记者所从事的事业，担负着传播先进文化，弘扬民族精神，维护国家利益, 促进经济社会发展，推动人类文明的崇高使命和社会责任。
第二条 热爱祖国和人民，珍视国家和人民赋予的权利,全心全意为人民服务,为社会主义服务,为党和国家工作的大局服务。
第三条 忠诚党的新闻事业，坚持党性原则，坚定执行党的路线、方针、政策。
第四条 自觉遵守宪法和法律、法规。
第五条 保守国家秘密。
第六条 真实报道新闻，正确引导舆论，努力传播知识，热情提供服务，不断满足广大人民群众的精神和文化需要。
二、真 实
第七条 广播电视编辑记者应该对报道内容的真实和准确负责，报道必须以事实为依据，不编造新闻，不歪曲、夸大事实。
第八条 消息来源必须真实可靠。应深入新闻现场采集第一手信息，保证新闻要素准确无误；未经证实的消息，应加以说明；除需要对提供信息者保密外，报道中应指明消息来源。
第九条 认真核实报道内容，包括基本事实、背景资料、引述转述语言等。对稿件中采用的声音、图像、数据、文件摘录及其他材料，做到真实、准确、科学、统一。
第十条 报道中的细节必须真实，不加以拔高、想象和夸张。报道所采用的声音、图像均应来自新闻现场或与报道主题相关的采编活动，而非个人编造或拼接。
第十一条 在报道、说明、解释和评论事实时，要全面把握和正确反映社会生活的本质和主流，避免因为报道肤浅、片面而导致公众对事物的判断产生偏差或错误。
第十二条 报道一经发布，如果发现错误，应立即公开更正。
三、公 正
第十三条 广播电视编辑记者应坚持客观公正的职业理念，坚持深入实际，调查研究，忠于事实，追求真理的职业精神。
第十四条 坚持准确、公正、全面、客观的报道原则。不从个人或小团体利益出发进行影响公共利益的报道。
第十五条 区分报道事实和评价事实，不将评论或猜测作为认定的事实发表。
第十六条 不参与任何可能有损于自身公正和信誉的组织及活动；不在自己服务的媒体上发表本人及亲属涉诉事件的报道和评论；不阻挠正当的舆论监督。
第十七条 正确行使舆论监督职能，勇于批评和揭露违法违纪行为、消极腐败现象和违背社会公德的不良风气，弘扬社会正气，捍卫社会公正，维护社会稳定。
第十八条 批评性或揭露性报道要有利于问题的解决。不追求所谓“轰动效应”、哗众取宠；不以个人情绪代替政策法律、发泄私愤、中伤他人。尊重被批评者申辩的权利。
第十九条 案件报道不应影响司法公正和法律判决。不偏袒诉讼任何一方；案件判决前，不作定罪、定性报道；不针对法庭审判活动进行暗访；报道公开审理的案件，应遵守相关法律规定。
第二十条 报道中避免对种族、性别、年龄、职业、宗教信仰、教育程度、居住地等的任何歧视。
四、导 向
第二十一条 广播电视编辑记者必须树立政治意识，大局意识，责任意识，坚持正确的舆论导向。
第二十二条 把好政治关、事实关、安全播出关。杜绝政治导向问题和政策性错误，不给不良言论、有害信息提供传播渠道。
第二十三条 坚持正面宣传为主的方针，及时传达党的主张，反映人民呼声，营造积极健康向上的舆论环境。
第二十四条 报道内容要符合特定的政治、经济、文化、道德、习俗等社会环境要求。
第二十五条 坚持正确的新闻价值取向，维护国家尊严、民族荣誉和社会道德规范。不宣扬利己主义、拜金主义、享乐主义的人生观、价值观和生活方式。
第二十六条 坚持把社会效益放在首位，严肃认真地考虑新闻传播的社会效果。不片面追求经济利益，不报道危害国家安全、影响社会稳定、违背社会公德、损害公共利益的内容。坚持报道的高品质、高品位，不迎合庸俗、低级趣味。
第二十七条 对重大事件、社会热点和敏感问题的报道，应注意把握分寸、时机、力度，释疑解惑，积极引导。不炒作和蓄意制造舆论“热点”，误导受众。
五、品 格
第二十八条 广播电视编辑记者应恪守敬业奉献、诚实公正、团结协作、遵纪守法的职业道德。
第二十九条 尊重公民和法人的名誉权、荣誉权，尊重个人隐私权、肖像权，不揭人隐私，避免损害他人名誉的报道。
第三十条 努力营造有利于未成年人健康成长的文化环境。不传播含有恐怖、暴力、色情、封建迷信和伪科学的内容。
第三十一条 报道意外事件，应顾及受害人及家属的感受，在提问和录音、录像时应避免对其心理造成伤害。
第三十二条 尊重和保护未成年人、妇女、老人和残疾人的合法权益。报道违法犯罪的未成年人和性侵犯的受害者时，录音、图像应经过特殊处理，使之不可辨认；不公布其真实姓名，不描述犯罪过程。
第三十三条 涉及使用其他新闻来源的报道时，应尊重其他新闻来源和相关作者的知识产权。对内容的选择应忠实于原作，不断章取义。
第三十四条 尊重采访对象的声明和要求，采访时应主动出示工作证件或单位介绍信。
第三十五条 保持良好的社会形象。进行报道活动时，衣着、语言和行为要符合大众审美情趣，避免在社会上产生不良影响。
第三十六条 同行之间互相尊重，互相学习，互相支持，开展正当的业务竞争。
六、廉 洁
第三十七条 广播电视编辑记者应该清正廉洁，克己奉公，反对任何形式的“有偿新闻”。
第三十八条 不利用职务之便，直接或间接地为本人、亲属及其他人谋取私利。
第三十九条 不擅自组团进行采访活动，不参加他人擅自组织的采访活动。不以任何名义索要、接受和借用报道对象的钱物。
第四十条 不以批评报道相威胁或以表扬报道相引诱，为个人和小团体谋利。不以“公开曝光”、“编发内参”等方式要挟他人以达到个人目的或其它不正当目的。
第四十一条 严格区分新闻报道与广告，不以任何形式从事广告和其他经营活动。不利用新闻报道拉赞助、拉广告；不以新闻报道形式为企业或产品做变相广告或形象宣传；广告和广告信息应有明确广告标识。
第四十二条 自觉遵守有关廉政的规章制度和财经纪律，自觉接受公众和有关部门的监督。
七、附 则
第四十三条 全国各广播电视制作、播出机构的编辑记者遵守本准则。
第四十四条 违犯本准则的编辑记者，将在行业内通报批评；触犯党纪政纪的，给予党纪政纪处分；触犯法律的，移送司法机关处理。
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